Gli Organismi responsabili del funzionamento della Borsa sono:   

La Deputazione, composta di sette componenti effettivi e di tre supplenti nominati dal Ministero delle Imprese e del Made in Italy, è preposta alla sorveglianza dell'andamento della Borsa e dell'osservanza delle leggi e delle disposizioni vigenti da parte degli operatori.   

Il Comitato di Borsa, nominato dalla Camera di Commercio, oltre a provvedere alla diretta vigilanza sull'attività dei mediatori e sul funzionamento del mercato, cura l'accertamento dei prezzi per la formazione del Listino di Borsa.    
La funzione di Segretario di entrambi gli organismi è attribuita al Direttore di Borsa che, conseguentemente, provvede a curare i rapporti tra gli stessi e l'Ente Camerale, Agro Camera, i singoli operatori.